2019年4月1日現在（五十音順、敬称略）
| 理事長 1名 | |
|---|---|
| 樋口 和秀 | 大阪医科大学内科学第二教室 |
| 監 事 4名 | |
| 桑野 博行 | 地方独立行政法人福岡市立病院機構福岡市民病院 |
| 杉山 敏郎 | 北海道大学先進消化器がん分子標的治療研究部門 |
| 高橋 信一 | 立正佼成会附属佼成病院 |
| 平石 秀幸 | 医療法人社団葵会 AOI七沢リハビリテーション病院 |
| 理 事 28名 | |
| 安藤 朗 | 滋賀医科大学消化器内科 |
| 飯石 浩康 | 市立伊丹病院 |
| 伊東 文生 | 聖マリアンナ医科大学消化器・肝臓内科 |
| 今枝 博之 | 埼玉医科大学病院消化管内科 |
| 岩切 勝彦 | 日本医科大学消化器内科学 |
| 大倉 康男 | PCL JAPAN 病理・細胞診センター川越ラボ |
| 小澤 壯治 | 東海大学医学部消化器外科 |
| 掛地 吉弘 | 神戸大学大学院外科学講座食道胃腸外科学分野 |
| 春日井 邦夫 | 愛知医科大学消化管内科 |
| 加藤 広行 | JA福島厚生連塙厚生病院外科 |
| 加藤 元嗣 | 国立病院機構函館病院 |
| 河合 隆 | 東京医科大学消化器内視鏡学講座 |
| 北川 雄光 | 慶應義塾大学医学部外科学 |
| 木下 芳一 | 製鉄記念広畑病院／はりま姫路総合医療センター整備推進機構 |
| 塩谷 昭子 | 川崎医科大学消化管内科学 |
| 城 卓志 | 蒲郡市民病院 |
| 瀬戸 泰之 | 東京大学大学院医学系研究科消化管外科学 |
| 高山 哲治 | 徳島大学大学院医歯薬学研究部消化器内科学 |
| 田中 信治 | 広島大学大学院医系科学研究内視鏡医学 |
| 中島 淳 | 横浜市立大学大学院医学研究科肝胆膵消化器病学教室 |
| 永原 章仁 | 順天堂大学医学部消化器内科 |
| 馬場 秀夫 | 熊本大学大学院生命科学研究部消化器外科学 |
| 福田 眞作 | 弘前大学大学院医学研究科消化器血液内科 |
| 藤原 靖弘 | 大阪市立大学大学院医学研究科消化器内科学 |
| 前原 喜彦 | 公立学校共済組合 九州中央病院 |
| 村上 和成 | 大分大学医学部消化器内科 |
| 八尾 隆史 | 順天堂大学学院医学研究科人体病理病態学講座 |
| 山本 博徳 | 自治医科大学内科学講座消化器内科学部門 |